Fylogenetický strom &Lyme Disease

Lymská nemoc jeutrpení způsobené bakterií Borrelia burgdorferi ,patogena přenášené klíšťaty blacklegged . Jak s mnoha jinými patogeny , biologové byli schopni rozluštit trochu B. burgdorferi v evoluční historii genetickou analýzou . Fylogenetický strom pro bakterie , jako je B. burgdorferi poskytuje vizuální znázornění svých vztahů s ostatními kmeny a druhy . Fylogenetické stromy

fylogenetický strom ukazuje evoluční vztahy mezi různými druhy . Každý " uzel " na stromě představujevznik nového druhu , a je-li dva druhy mohou vystopovat jejich původ zpátky do jednoho uzlu , tento uzel představuje nejnovější bod v čase , že tyto dva druhy sdílený společný předek . Tyto stromy jsou konstruovány na základě fyzických a genetických vlastnostech , a evoluční biologové jsou často nuceni změnit , pokud nová data přichází na světlo .
Borrelia

Borrelia je vlastně rod bakterií, které obsahuje více druhů . Počet druhů Borrelia zvýšil několikrát v průběhu posledních dvou desetiletí , jak byly identifikovány další kmeny . Definice druhů borelií či jiných rodů bakterií je ve skutečnostivelmi ošidné problém . Kde se obávají, rostliny a zvířata , biologové již tradičně definovány druhy na základě jejich neschopnost chovat a produkovat úrodná potomstva . Kůň a osel může chovat , například , alemezek , že výsledky je sterilní , takže koně a osli jsou samostatné druhy . Bakterie však množí asexuálně , tak tato definice je irelevantní . V důsledku toho , pro borelie a pro mnoho jiných bakterií , mikrobiologů definovat druhy rozdíl založený na technice zvané celá DNA - DNA hybridizace .
Vztahy

Vědci mají postavené fylogenetické stromy pro Borrelia druhu na základě techniku ​​zvanou multilokusová sekvenční analýza ( MPSV ) , který se zaměřuje na rozdíly mezi specifickou " úklid " přítomné ve všech různých druhů genů . Biologové používají tento software k vytvoření " nejvíce šetrný strom " -Fylogenetický strom, který vyžaduje nejmenší počet evolučních změn, k vysvětlení pozorovaných rozdílů . Výsledky této metody , ale často je třeba zlepšit , když k dispozici nové informace .
Vztahy

V současné době , B. burgdorferi sensu stricto sdílí svůj nejnovější společný předek s B. bissettii; tito dva zase sdílejí společný předek s B. lusitaniae . Všechny tři druhy se lišily od společného předka , které sdílejí s B. afzelii , B. spielmanii , B. garinii a B. bavariensis . Tato skupina druhů pak se lišil od společného předka sdílené s B. valaisiana . To je důležité pro poznámku, nicméně , že tento fylogenetický strom by mohla velmi dobře změnit v budoucnu jako nová data přichází na světlo . Zvláště , to je docela možné, žeklesající náklady na sekvencování genomu by mohla mít vliv na způsob, jakým jsou fylogenetické stromy vyvinutý pro bakterie , jako je B. burgdorferi .